世纪之末，一场突如其来的洪水即将席卷Griffin岛。动物们在狮子领袖的带领下登陆一艘空前绝后的大船——诺亚方舟，不过不是所有动物都可以登上方舟。戴夫和芬尼是对呆萌可爱的喜欢旅行的父子俩，由于未在名单内，父子俩被禁止登陆方…

　　诺亚方舟漂流在海上，数周都看不到陆地，方舟粮食库存在不断减少，食肉动物和食草动物之间脆弱的和平随时可能被打破。芬妮和莉亚连同船上最后的食物，在一次意外中落入海里。莉亚和新朋友果冻飘到一座岛屿上，而芬妮落入一个被火山威…