世纪之末，一场突如其来的洪水即将席卷Griffin岛。动物们在狮子领袖的带领下登陆一艘空前绝后的大船——诺亚方舟，不过不是所有动物都可以登上方舟。戴夫和芬尼是对呆萌可爱的喜欢旅行的父子俩，由于未在名单内，父子俩被禁止登陆方…

　　一出生就失去了父母的小麻雀理查德被一个鹳家庭收养，在养父母和哥哥的关爱中快乐长大的理查德做梦也没有想到自己根本就不是一只鹳。直到全家即将向温暖的非洲进发时，理查德才不得不面对这一现实：小麻雀是无法完成长途迁徙的。理查…

　　诺亚方舟漂流在海上，数周都看不到陆地，方舟粮食库存在不断减少，食肉动物和食草动物之间脆弱的和平随时可能被打破。芬妮和莉亚连同船上最后的食物，在一次意外中落入海里。莉亚和新朋友果冻飘到一座岛屿上，而芬妮落入一个被火山威…