凹凸世界的创世神是一位很肆意随性的神明，他创造了凹凸世界的无数星球和人民，又随心所欲地统治着他们。同时他还设立了七神使，让他们代行神旨。　　但是，创世神也不是完全不给他的子民机会——只要在“凹凸大赛”中获得最终的胜利…

《凹凸学园第二季》是动画《凹凸世界》的番外衍生剧第二季，故事主要讲述了凹凸大赛的参赛者们作为中学生上学期间的日常故事。在这一季中大家举办了学园祭、经历了转学风波、同时也有教员们和家长们的苦恼。