《忍者龟》新系列的故事发生在纽约曼哈顿，在热闹的市区的地下水道里，生活着主人公：四只少年忍者龟和一只六英尺高的老鼠——他们的老师斯普林特。　　某一天，作为人类的斯普林特不幸遭受了一种神奇绿色物质的辐射，变异成了一只老…

　　在一场意外中，芭芭拉（朱迪思·欧迪 Judith O'Dea 饰）和哥哥遭到了丧尸的袭击，这些活死人个性凶残样貌可怖，在它们的脑袋里，只装了一件事情，那就是“吃”。受伤的哥哥不幸感染了病毒成为了丧尸中的一员，悲痛和恐惧之中，芭芭拉…

　　摩根被人设计将有毒废物倒入他工作的矿区内，导致东非尚比亚数千里居民死亡，被当地政府驱逐出境。数月后，由杜邦处得知害他的史考特并没死，且藏身于当地反判军内，于是决定返非讨回名声，找出被藏匿的放射能污染物。怎知这一切其实…